هناك عدة عوامل تؤدي إلى تلف المخطوط وهي كالتالي :-
-العوامل الطبيعية والمتمثلة في الحرارة والرطوبة والضوء
-العوامل البيولوجية والمتمثلة في الفطريات والبكتريا والحشرات والقوارض...الخ
-العوامل الكيميائية والمتمثلة في الغازات واكسدتها التي تعود بالضرر على اوراق المخطوط وتفقدها مرونتها ومنها غاز ثاني اكسيد الكبريت الذي يتحول بفعل الرطوبة إلى حمض أكسيد الكبريت الذي يؤدي إلى هشاشة الأوراق وبالتالي تفتتها وتكسرها وتشققها.فكل هذه العوامل تؤدي إلى التلف إضافة إلى عامل أخرى وهو الإنسان ،فقد يكون الإنسان الإنسان سبباً في إتلافها بالإهمال واللامبالاة وعدم إجادة التعامل معها ،مثلا إستعمال العظمة في تقليب الصفحات ،إستعمال حامل لنقلها من مكان إلى آخر،منع طي اوراق المخطوط في تحديد الصفحات ، منع إستعمال القلم الجاف اثناء المعاينة وإستعمال قلم الرصاص، ...الخ.
